More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0067 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  74.8 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  64.46 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  64.46 
 
 		 121 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  62.81 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  63.11 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  60.33 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  61.98 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  61.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  59.84 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  61.48 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  59.5 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  62.81 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  62.81 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  57.85 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  57.85 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  46.28 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  46.02 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  42.37 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1787  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.860265  normal  0.648843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  41.67 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  36.21 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  43.36 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  42.98 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 127 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  43.86 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  43.86 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  42.11 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  43.86 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  38.98 
 
 		 148 aa  86.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  41.23 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  41.23 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  41.23 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 121 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2370  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 414 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  38.66 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  39.17 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  38.6 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  38.94 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  38.6 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 394 aa  80.1  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.39 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  35.71 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>