More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0065 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
812 aa  1571    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  47.8 
 
 
807 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  33.79 
 
 
888 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  36.14 
 
 
766 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
878 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
921 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
728 aa  370  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  35.14 
 
 
742 aa  369  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
760 aa  351  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.75 
 
 
942 aa  341  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  34.84 
 
 
928 aa  339  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
921 aa  335  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  33.72 
 
 
925 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
937 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
937 aa  333  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  30.68 
 
 
910 aa  332  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  33.28 
 
 
927 aa  331  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
934 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
911 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  32.94 
 
 
927 aa  328  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  29.13 
 
 
801 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
916 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  34.45 
 
 
916 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
770 aa  319  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  31.93 
 
 
934 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  31.93 
 
 
922 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
1063 aa  317  7e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  39.37 
 
 
870 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
935 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
822 aa  310  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  32.6 
 
 
770 aa  306  9.000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  32.82 
 
 
601 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  40.36 
 
 
819 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  32.14 
 
 
769 aa  301  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
792 aa  298  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.39 
 
 
770 aa  297  5e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  31.47 
 
 
774 aa  297  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.57 
 
 
769 aa  296  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
598 aa  295  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
796 aa  293  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  31.26 
 
 
769 aa  292  2e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
673 aa  291  4e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
607 aa  288  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  35.38 
 
 
552 aa  287  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  35.38 
 
 
552 aa  287  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.01 
 
 
639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  33.45 
 
 
610 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  31.22 
 
 
1104 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
681 aa  279  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
1085 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
691 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
604 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
660 aa  268  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.57 
 
 
785 aa  264  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.12 
 
 
783 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.79 
 
 
803 aa  262  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
687 aa  260  6e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2285  CheA signal transduction histidine kinases  30.86 
 
 
584 aa  260  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
671 aa  258  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
674 aa  257  5e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  34.12 
 
 
754 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  35.92 
 
 
692 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.17 
 
 
927 aa  255  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
737 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
673 aa  255  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
871 aa  254  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
730 aa  254  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  38.02 
 
 
751 aa  253  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2736  CheA signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 
687 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.26 
 
 
767 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  32.84 
 
 
625 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
685 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
685 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
650 aa  252  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
747 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3199  chemotaxis protein CheA  34.29 
 
 
561 aa  251  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.18 
 
 
1089 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
671 aa  250  8e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
747 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
743 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
739 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  31.35 
 
 
887 aa  249  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  36.27 
 
 
748 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  36.34 
 
 
753 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3091  CheA signal transduction histidine kinases  33.21 
 
 
538 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.832082  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  34.02 
 
 
723 aa  248  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
679 aa  247  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
652 aa  246  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
666 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  35.99 
 
 
758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.99 
 
 
754 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
1031 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  35.73 
 
 
748 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  35.59 
 
 
744 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0622  CheA signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
543 aa  244  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
742 aa  244  6e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
954 aa  244  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
741 aa  243  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>