30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0048 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  45.1 
 
 		 307 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  45.88 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  46.64 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  38.78 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  36.26 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  28.03 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  27.12 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.9 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  27.96 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  23.83 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  29.77 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  27.08 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  23.77 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  25.21 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  26.45 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  24.23 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0478  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  33.16 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  23.58 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 		 216 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6367  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3611  aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3734  aminoglycoside phosphotransferase  27.32 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>