More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0043 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 		 591 aa  779    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 596 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 		 607 aa  803    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 600 aa  744    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 623 aa  737    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 623 aa  744    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  62.52 
 
 		 595 aa  769    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 597 aa  779    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 604 aa  770    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 		 595 aa  759    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 		 604 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 593 aa  1217    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 590 aa  744    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 590 aa  759    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 605 aa  709    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 591 aa  790    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 604 aa  716    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 		 605 aa  720    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 		 625 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  61.51 
 
 		 595 aa  755    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 		 609 aa  796    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 606 aa  855    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  62.52 
 
 		 595 aa  769    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 590 aa  771    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  70.61 
 
 		 593 aa  870    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 588 aa  683    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 590 aa  743    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 591 aa  754    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 590 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 591 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 		 590 aa  771    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 590 aa  760    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  67.64 
 
 		 599 aa  828    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 591 aa  790    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 		 594 aa  757    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  79.6 
 
 		 619 aa  983    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 594 aa  763    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 608 aa  702    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 		 590 aa  764    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  68.99 
 
 		 595 aa  835    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 604 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 		 605 aa  791    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 		 601 aa  712    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 608 aa  707    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 		 604 aa  752    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  60.23 
 
 		 596 aa  742    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 		 590 aa  759    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  63.71 
 
 		 614 aa  754    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  58.21 
 
 		 606 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 		 591 aa  767    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 		 601 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 596 aa  751    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 581 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 600 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 588 aa  539  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 591 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 591 aa  531  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 591 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 591 aa  535  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 591 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 591 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 589 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 586 aa  529  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 603 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 589 aa  525  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 590 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 604 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 594 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 589 aa  520  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 591 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 592 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 598 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 619 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 592 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 607 aa  515  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 593 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 627 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 593 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 589 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 596 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 593 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 600 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 1019 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 594 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 600 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3164  aspartyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 591 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2366  aspartyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 586 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 584 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 594 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 594 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 578 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 614 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 613 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>