39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0006 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2900  hypothetical protein  37.44 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2817  hypothetical protein  37.44 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2997  hypothetical protein  36.97 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1083  hypothetical protein  38.14 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3253  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1266  protein of unknown function DUF1449  36.02 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.654061  hitchhiker  0.000225209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3110  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0803  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3100  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1185  hypothetical protein  37.62 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1376  hypothetical protein  36.02 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3021  hypothetical protein  38.81 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0945  hypothetical protein  35.68 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2219  hypothetical protein  39.25 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.185785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3623  hypothetical protein  35.1 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01974  hypothetical protein  30.1 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.64724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3145  protein of unknown function DUF1449  35.76 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4674  hypothetical protein  37.78 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3342  putative inner membrane protein  29.9 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3513  putative inner membrane protein  28.99 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02920  predicted inner membrane protein  28.99 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02870  hypothetical protein  28.99 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3226  putative inner membrane protein  28.99 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.507681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0650  protein of unknown function DUF1449  28.99 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0649  hypothetical protein  28.99 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2196  hypothetical protein  36.81 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.710845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1795  hypothetical protein  33.56 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.335298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0681  protein of unknown function DUF1449  33.56 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00978896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2881  protein of unknown function DUF1449  36.65 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752639  normal  0.082564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3457  inner membrane protein YqiJ  28.35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.832198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3451  hypothetical protein  28.35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.674317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3383  inner membrane protein YqiJ  28.35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3553  inner membrane protein YqiJ  28.35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0669  hypothetical protein  32.19 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603513  normal  0.609229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3387  inner membrane protein YqiJ  27.84 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1412  hypothetical protein  31.89 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4041  hypothetical protein  26.18 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.832413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0264  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0832208  normal  0.0172457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>