91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0005 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  100 
 
 		 569 aa  1113    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  50.81 
 
 		 587 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  49.46 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  49.91 
 
 		 592 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  49.46 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  49.46 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  49.46 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  49.91 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  49.91 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  49.37 
 
 		 590 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  48.05 
 
 		 604 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  49.64 
 
 		 592 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  50.89 
 
 		 585 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  50.44 
 
 		 589 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  50.95 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  50.18 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.1 
 
 		 553 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  49.63 
 
 		 542 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  49.27 
 
 		 553 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  49.27 
 
 		 553 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  49.27 
 
 		 553 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  49.27 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  49.27 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.82 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  48.67 
 
 		 570 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  49.62 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  49.43 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  49.15 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  49.43 
 
 		 559 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  49.25 
 
 		 559 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  48.78 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  47.69 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  47.25 
 
 		 562 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  46.75 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  45.37 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  56.99 
 
 		 964 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  46.81 
 
 		 560 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  33.92 
 
 		 542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  33.83 
 
 		 744 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  32 
 
 		 672 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  31.75 
 
 		 693 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  30.93 
 
 		 688 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  30.93 
 
 		 688 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  31.44 
 
 		 679 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  30.51 
 
 		 681 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  29.41 
 
 		 691 aa  141  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  28.54 
 
 		 712 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 672 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  30.1 
 
 		 700 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  30.35 
 
 		 667 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  27.59 
 
 		 644 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  29.08 
 
 		 668 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  29.18 
 
 		 748 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  24.8 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  24.8 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  24.66 
 
 		 475 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  27.61 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  29.46 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  25.78 
 
 		 695 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  24.91 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  27.5 
 
 		 526 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  27.5 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  27.5 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  27.5 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.5 
 
 		 526 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.5 
 
 		 526 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  27.5 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.5 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  26.5 
 
 		 524 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  23.41 
 
 		 495 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  27.6 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  26.08 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  26.5 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  26.4 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  25.77 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  23.37 
 
 		 468 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  25.43 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  25.77 
 
 		 490 aa  67  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  25.58 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  26.7 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  25.49 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  24.32 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  26.07 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  23.59 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  25 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  26.67 
 
 		 503 aa  50.8  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  24.84 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  24.51 
 
 		 516 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  21.56 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  24 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  25.19 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>