119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0004 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  213  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0206  hypothetical protein  44.34 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000028641  hitchhiker  0.0000951882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0226  hypothetical protein  44.34 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0355  hypothetical protein  43.36 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000016256  hitchhiker  0.000400939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1603  hypothetical protein  50.49 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3593  hypothetical protein  49 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000700464  normal  0.124416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2762  hypothetical protein  40.35 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.340098  normal  0.38705 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0764  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0692  membrane protein  41.12 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.874009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0419  hypothetical protein  44.34 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000652034  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2982  hypothetical protein  42.11 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01185  hypothetical protein  39.62 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004250  hypothetical protein  40.57 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000539124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3469  hypothetical protein  39.47 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0108117  hitchhiker  0.000383928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1903  protein of unknown function DUF423  50.57 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3902  hypothetical protein  40 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4468  hypothetical protein  36.45 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3320  hypothetical protein  42.11 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00120689  normal  0.931239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2201  hypothetical protein  39.22 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2079  hypothetical protein  40.71 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3505  hypothetical protein  39.82 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.248867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4023  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1284  hypothetical protein  39.25 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00814173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3913  hypothetical protein  37.82 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02564  uncharacterized small membrane protein  41.07 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00480554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1366  hypothetical protein  39.25 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0307163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1352  hypothetical protein  39.25 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.679146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1391  hypothetical protein  39.25 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.129642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2994  protein of unknown function DUF423  39.25 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103925  hitchhiker  0.00000155548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04960  hypothetical protein  42.98 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.492917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0230  hypothetical protein  38.94 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0432  hypothetical protein  47.22 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3149  hypothetical protein  41.03 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08455  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0764  hypothetical protein  51.61 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0328  protein of unknown function DUF423  40.16 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.858167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3177  hypothetical protein  43.69 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2563  hypothetical protein  31.82 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3804  hypothetical protein  41.23 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00311639  unclonable  0.0000000190492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5571  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5521  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5090  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2261  protein of unknown function DUF423  45.92 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.328273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5185  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5515  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5487  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3413  hypothetical protein  39.09 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0478  hypothetical protein  42.11 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5243  hypothetical protein  37.61 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5073  hypothetical protein  36.67 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000730403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5642  hypothetical protein  37.61 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4742  hypothetical protein  46.3 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2781  hypothetical protein  39.81 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1549  protein of unknown function DUF423  40.37 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  normal  0.221976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02658  conserved inner membrane protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0881  protein of unknown function DUF423  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2951  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.01255e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3113  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0905  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2948  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000825789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3063  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.47901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02619  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4071  hypothetical protein  41.75 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5106  hypothetical protein  41.59 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.167348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3376  hypothetical protein  40.38 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.432758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0895  protein of unknown function DUF423  42 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4979  hypothetical protein  41.59 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0331  protein of unknown function DUF423  41.44 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.120447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0152  hypothetical protein  41.44 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3253  hypothetical protein  39.42 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0606  hypothetical protein  37.04 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0620  hypothetical protein  37.04 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3206  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3191  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0186134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3143  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00090815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3126  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000001734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3306  hypothetical protein  38.83 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0654782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0928  hypothetical protein  39.81 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00438881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02960  hypothetical protein  44.35 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3368  protein of unknown function DUF423  36.11 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00388391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1612  membrane protein DUF423  39.6 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221104  normal  0.524793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5156  hypothetical protein  41.59 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.444342  normal  0.879938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2499  hypothetical protein  38.39 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.300029  decreased coverage  0.000130725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3477  protein of unknown function DUF423  38.6 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0890  protein of unknown function DUF423  45.45 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0637  protein of unknown function DUF423  35.34 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1195  hypothetical protein  39.64 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.991321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2013  protein of unknown function DUF423  37.74 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1117  protein of unknown function DUF423  40.4 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206789  normal  0.818653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2793  hypothetical protein  40.62 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00315578  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0359  hypothetical protein  43.12 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0698  hypothetical protein  47.22 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2407  hypothetical protein  38.89 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1535  hypothetical protein  39.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2722  hypothetical protein  39.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000162987  normal  0.0799022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2892  hypothetical protein  39.58 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000389686  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4169  hypothetical protein  41.44 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4139  protein of unknown function DUF423  48.81 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2993  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5332  hypothetical protein  42.2 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.423162  normal  0.234903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>