More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0001 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 477 aa  975    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.62 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  53.51 
 
 		 498 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  51.1 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  52.7 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  50.79 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  46.82 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  46.93 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  50.79 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  48 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  46.96 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  47.8 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  49.78 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.3 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.56 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.75 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  42.03 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0001  chromosomal replication initiation protein  50.44 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.21 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  41.72 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  41.38 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  42.22 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.99 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  41.99 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  41.58 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.08 
 
 		 462 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  40.56 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  42.79 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  40.39 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  41.74 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  40.39 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  40.39 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  40.78 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  40.39 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  40.52 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  40.69 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  40.73 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  40.61 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  41.63 
 
 		 468 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 		 462 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  42.07 
 
 		 473 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  41.91 
 
 		 472 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.35 
 
 		 461 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  39.7 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  41.49 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  40.36 
 
 		 494 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  39.67 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  40.48 
 
 		 452 aa  359  6e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 		 468 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  39.88 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.69 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  39.88 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  40.92 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  39.43 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  39.43 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  42.13 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  39.51 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.96 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  39.51 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  41.44 
 
 		 475 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  42.46 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 		 450 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  40.8 
 
 		 450 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  39.37 
 
 		 446 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  40.59 
 
 		 498 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  37.9 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  39.73 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  41.72 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  38.78 
 
 		 457 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  38.78 
 
 		 457 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 		 455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  38.49 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.35 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  38.93 
 
 		 446 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.56 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000132407  decreased coverage  0.000453889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>