More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1011    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7083  hypothetical protein  43.39 
 
 
502 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  34.62 
 
 
1224 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 
1209 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 
1184 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 
1263 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 
1168 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  31.91 
 
 
1184 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  32.33 
 
 
1219 aa  196  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.04 
 
 
1217 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  29.11 
 
 
1219 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0037  hypothetical protein  28.33 
 
 
623 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0046  hypothetical protein  28.33 
 
 
623 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0027  hypothetical protein  26.91 
 
 
623 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.476694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  27.41 
 
 
498 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
477 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  26.56 
 
 
473 aa  90.9  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  33.74 
 
 
544 aa  87  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 
556 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
691 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  27.13 
 
 
692 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.16 
 
 
625 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.64 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 
666 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
730 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
622 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
679 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.01 
 
 
627 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.8 
 
 
647 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.53 
 
 
598 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
612 aa  70.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.73 
 
 
650 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  27.1 
 
 
621 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.9 
 
 
602 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.41 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
545 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.78 
 
 
662 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.02 
 
 
707 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.6 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.86 
 
 
666 aa  67  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  28 
 
 
618 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  28.63 
 
 
672 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.71 
 
 
579 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
595 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
646 aa  65.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
710 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  29.93 
 
 
503 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
636 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.09 
 
 
635 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  23.97 
 
 
638 aa  64.3  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
703 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
776 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  27.73 
 
 
593 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  30.12 
 
 
1652 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
425 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  24.5 
 
 
612 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  34.81 
 
 
623 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
651 aa  61.6  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
615 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 
624 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
625 aa  60.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 
624 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 
624 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.69 
 
 
664 aa  60.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
598 aa  60.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.34 
 
 
591 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1760  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 
399 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.66 
 
 
667 aa  60.5  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  24.86 
 
 
625 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.78 
 
 
614 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.39 
 
 
533 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.86 
 
 
715 aa  60.1  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  22.9 
 
 
614 aa  60.1  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.48 
 
 
652 aa  60.1  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  26.87 
 
 
557 aa  60.1  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  22.66 
 
 
825 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
673 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.41 
 
 
601 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0335  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.78 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.83 
 
 
653 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  30.81 
 
 
623 aa  59.3  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  31.86 
 
 
1109 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5305  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.98 
 
 
581 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.46 
 
 
594 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  30.65 
 
 
596 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.88 
 
 
696 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  29.41 
 
 
561 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 
487 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.55 
 
 
604 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
480 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  25.14 
 
 
625 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0359  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
631 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.23 
 
 
668 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  25.65 
 
 
662 aa  57  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.08 
 
 
627 aa  57  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 
646 aa  57  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
678 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  31.87 
 
 
443 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>