More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  100 
 
 		 152 aa  303  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  67.11 
 
 		 151 aa  211  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  55.33 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  56.38 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  56.08 
 
 		 148 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  54.67 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  53.02 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  54.73 
 
 		 148 aa  157  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  54.36 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  54.3 
 
 		 149 aa  157  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  52.67 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  53.33 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  52.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 148 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  51.33 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  51.68 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  54.05 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  48.32 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  52.03 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  50 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  46.36 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  50.68 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  46.36 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  44.59 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  46.36 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  42.67 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  32.89 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  41.45 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  42.21 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  34.9 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  34.69 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  34.87 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  34 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  36 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  38.26 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  34.67 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 191 aa  90.9  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  40.26 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2006  ribosomal protein L9  35.48 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  38.06 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  42.11 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3432  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  38 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5596  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5339  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000103383  hitchhiker  0.00000000147927 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  36.88 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5620  50S ribosomal protein L9  38.17 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000412151  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  36 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5657  50S ribosomal protein L9  38.17 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 		 147 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 194 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  35.57 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  34.21 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  35.76 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>