244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39320 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  77.71 
 
 		 181 aa  240  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  64.64 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  59 
 
 		 224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  63.37 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  67.03 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  69.36 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  56.65 
 
 		 201 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  57.78 
 
 		 205 aa  197  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 229 aa  197  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  68.9 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  68.9 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  68.9 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  62.37 
 
 		 249 aa  194  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  53.67 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  60.56 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  59.78 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  63.79 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  60.67 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  49.45 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  56.65 
 
 		 272 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  48.04 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  46.11 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  50.86 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  49.42 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28.98 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  36.31 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  29.38 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  41.77 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.88 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.73 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  45.9 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  32.63 
 
 		 109 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 111 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 174 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 107 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  22.62 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  23.21 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  40.32 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.02 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 123 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  22.62 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.02 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.02 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.02 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.02 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  26.85 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  40.24 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  29.61 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25.67 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 116 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  38.82 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 110 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>