More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.35 
 
 		 612 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.54 
 
 		 612 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.26 
 
 		 612 aa  666    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  100 
 
 		 644 aa  1266    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.58 
 
 		 641 aa  599  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  52.97 
 
 		 634 aa  589  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.59 
 
 		 628 aa  589  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.46 
 
 		 639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.5 
 
 		 688 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  47.82 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  47.95 
 
 		 672 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  47.03 
 
 		 699 aa  521  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  47.67 
 
 		 697 aa  392  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  42.9 
 
 		 584 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  37.27 
 
 		 503 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  38.01 
 
 		 581 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  36.13 
 
 		 504 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.84 
 
 		 493 aa  293  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  35.52 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  33 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  29.81 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  30.12 
 
 		 470 aa  140  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  41.83 
 
 		 186 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  42.5 
 
 		 193 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  42.75 
 
 		 193 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.85 
 
 		 589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  40.58 
 
 		 197 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 		 596 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  40.58 
 
 		 197 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  41.18 
 
 		 193 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  37.04 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  39.29 
 
 		 591 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  41.3 
 
 		 193 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  41.3 
 
 		 193 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  40.91 
 
 		 469 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.57 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  37.66 
 
 		 189 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.85 
 
 		 623 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  35.26 
 
 		 188 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  37.06 
 
 		 369 aa  107  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  40.12 
 
 		 381 aa  107  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  37.86 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.14 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.14 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.14 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.32 
 
 		 609 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.01 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40 
 
 		 625 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  38.27 
 
 		 187 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.6 
 
 		 622 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.09 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  39.1 
 
 		 622 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  36.99 
 
 		 659 aa  104  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.3 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  37.86 
 
 		 592 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  40.29 
 
 		 178 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  38.3 
 
 		 581 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.81 
 
 		 570 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  35.66 
 
 		 695 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.55 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.37 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  37.59 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  38.85 
 
 		 178 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  38.85 
 
 		 184 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.1 
 
 		 626 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.59 
 
 		 596 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.32 
 
 		 598 aa  98.2  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  38.13 
 
 		 178 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.87 
 
 		 200 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.3 
 
 		 589 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 963 aa  91.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  30.7 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1750 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.4 
 
 		 439 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1051 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.23 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.46 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.49 
 
 		 1130 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  31.21 
 
 		 165 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.03 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1030 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.32 
 
 		 1293 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  30.5 
 
 		 165 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.65 
 
 		 693 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  32.56 
 
 		 160 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.57 
 
 		 168 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 2296 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.21 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.96 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  30.15 
 
 		 735 aa  60.1  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.71 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  27.86 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0802  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.61 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 850 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  27.86 
 
 		 165 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>