295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  48.66 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 184 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  47.51 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 188 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  48.31 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 166 aa  97.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.83 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 415 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.29 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  30.29 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 234 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  36.3 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  57.14 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0836  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4477  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47529  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  35 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  52.94 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>