More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 
253 aa  497  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 
259 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.52 
 
 
250 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.2 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.757683  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.8 
 
 
252 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.092001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.55 
 
 
258 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.354983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
254 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.485174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.37 
 
 
269 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.37 
 
 
258 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.02 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.316114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
269 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
253 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0605466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.18 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.617745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.26 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25790  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.76 
 
 
282 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.25 
 
 
258 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
255 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
259 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35320  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.97 
 
 
249 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135035  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
269 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05610  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.77 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.100134  normal  0.886117 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.608737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.23 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19470  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.03 
 
 
287 aa  178  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
263 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
272 aa  169  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
265 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0355963  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27130  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.43 
 
 
258 aa  168  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
262 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.128983  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 
262 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418257  normal  0.135019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.951732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  44.69 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
271 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
266 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308915  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1901  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
266 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
270 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
266 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.662669  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
266 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177624  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
281 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.699263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
276 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.118299  decreased coverage  0.00158374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
266 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642907  decreased coverage  0.0040913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
269 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4040  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
264 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128419  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  39.04 
 
 
267 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
264 aa  155  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
270 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312813  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2716  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
265 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5551  putative short-chain dehydrogenase  43.42 
 
 
265 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
266 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.498015  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
261 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.30567  hitchhiker  0.00567391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
277 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63890  putative short-chain dehydrogenase  43.56 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5145  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
267 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645114  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
265 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.15353 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
264 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.576998  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
271 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
266 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
267 aa  148  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
261 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
271 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
262 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
261 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.8 
 
 
258 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
285 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
258 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00673203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
260 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
269 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
271 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  39.54 
 
 
266 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
264 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
269 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.356237  normal  0.14087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
264 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2989  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.99 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0851531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3183  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  39.84 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.58 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
259 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.228735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>