251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  37.11 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  33.91 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  31.6 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  31.6 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  33.8 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  47.35 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  41.07 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  42.59 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  41.75 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  42.31 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  40.85 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  38.13 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  34.8 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.38 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  35.38 
 
 		 453 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  30.54 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  24.92 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  28.24 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  26.5 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.48 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.71 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  31.74 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25.33 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.47 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  28.14 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  26.76 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  31.98 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  20.39 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  24.58 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  31.98 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  24.14 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  21.33 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  31.98 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  24.75 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.91 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  24.75 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  27.57 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0652  PfkB domain-containing protein  30.35 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  31.34 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.37 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.83 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  28.47 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  26.8 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  28.21 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  26.55 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  22.15 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  27.57 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  24.05 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  22.67 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  22.67 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  26.8 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  26.8 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  26.8 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  26.8 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  23.79 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.17 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.27 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  24.23 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  24.48 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.49 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  28.57 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  27.89 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.83 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  25.27 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  23.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  25.27 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  25.27 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  26.8 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  26.8 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.46 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  23.68 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25.69 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  24.46 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  26.8 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  26.8 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  26.8 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  26.8 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  26.8 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  25.84 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1475  ribokinase-like domain-containing protein  28.24 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  26.8 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  27.36 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.32 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  21.89 
 
 		 403 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.35 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  21.28 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 341 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>