37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37920  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6865  hypothetical protein  63.87 
 
 		 125 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.915134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0943  hypothetical protein  64.17 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.506387  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3341  hypothetical protein  69.15 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8989  hypothetical protein  59.02 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4542  hypothetical protein  53.54 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4629  hypothetical protein  53.54 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4925  hypothetical protein  53.54 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5115  hypothetical protein  54.69 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104477  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34170  hypothetical protein  57.72 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4764  hypothetical protein  58.41 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10822  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.225066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3092  hypothetical protein  56.91 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4042  hypothetical protein  54.84 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0080091  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2358  hypothetical protein  51.22 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0302  hypothetical protein  58.12 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0162  hypothetical protein  61.7 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2910  hypothetical protein  55.2 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2746  hypothetical protein  62.77 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1633  hypothetical protein  53.12 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0295  hypothetical protein  59.14 
 
 		 255 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0093  hypothetical protein  58.95 
 
 		 270 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3190  hypothetical protein  52.76 
 
 		 125 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4386  hypothetical protein  60.82 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5050  hypothetical protein  56.7 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6144  hypothetical protein  53.1 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3409  hypothetical protein  58.7 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7211  hypothetical protein  56.84 
 
 		 336 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0862974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06030  hypothetical protein  51.13 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.824286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2073  hypothetical protein  59.77 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4320  hypothetical protein  51.26 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.406277  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3577  hypothetical protein  53.6 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.345774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08930  hypothetical protein  51.64 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18580  hypothetical protein  50.89 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3525  hypothetical protein  45.31 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0022  hypothetical protein  44.09 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.424927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1391  hypothetical protein  42.22 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>