More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  68.49 
 
 
505 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  69.15 
 
 
515 aa  674    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  76.35 
 
 
527 aa  748    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  69.62 
 
 
484 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  70.13 
 
 
502 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  68.46 
 
 
514 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  72.8 
 
 
525 aa  766    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  76.67 
 
 
511 aa  768    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0094  amidophosphoribosyltransferase  69.67 
 
 
544 aa  665    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  74.69 
 
 
517 aa  757    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  71.52 
 
 
519 aa  712    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  66.47 
 
 
513 aa  684    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7210  amidophosphoribosyltransferase  70.97 
 
 
623 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
512 aa  1034    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  79.72 
 
 
525 aa  822    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  75.6 
 
 
534 aa  764    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  67.27 
 
 
500 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  76.67 
 
 
511 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  74 
 
 
512 aa  736    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  65.3 
 
 
496 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  71.12 
 
 
526 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18600  amidophosphoribosyltransferase  66.95 
 
 
537 aa  637    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  65.74 
 
 
518 aa  662    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  75.66 
 
 
511 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0300  amidophosphoribosyltransferase  68.23 
 
 
498 aa  663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  65.16 
 
 
517 aa  661    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  66.74 
 
 
558 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  69.15 
 
 
515 aa  683    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  70.13 
 
 
478 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  67.38 
 
 
506 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  66.31 
 
 
563 aa  646    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  67.5 
 
 
514 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  76.67 
 
 
511 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  75.66 
 
 
510 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  69.77 
 
 
515 aa  687    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  74.2 
 
 
526 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  53.32 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
474 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
488 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
482 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  50.42 
 
 
493 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  53.3 
 
 
488 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  51.68 
 
 
503 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
493 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04200  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
496 aa  474  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289108  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  49.26 
 
 
492 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  50.75 
 
 
488 aa  466  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  50.21 
 
 
482 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
466 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
487 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
466 aa  464  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
497 aa  464  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
466 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
496 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
472 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
494 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  51.8 
 
 
485 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
475 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  47.72 
 
 
477 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
468 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
465 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  52.01 
 
 
485 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
478 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  48.03 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  47.81 
 
 
472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
499 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
470 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
471 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  47.03 
 
 
474 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 
470 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  44.82 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  46.81 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  48.69 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
472 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
471 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0004  amidophosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
501 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
473 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  46.77 
 
 
473 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  47.38 
 
 
461 aa  435  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  51.54 
 
 
473 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  45.59 
 
 
465 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
480 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  45.79 
 
 
480 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2299  amidophosphoribosyltransferase  49.58 
 
 
465 aa  428  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>