More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 527 aa  1041    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  52.47 
 
 		 556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  51.81 
 
 		 524 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  48 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.02 
 
 		 583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.05 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.05 
 
 		 539 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  42.57 
 
 		 539 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.54 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.65 
 
 		 546 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.3 
 
 		 503 aa  320  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.14 
 
 		 558 aa  316  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.16 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.17 
 
 		 540 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.5 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  29.16 
 
 		 529 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  29.64 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  0.000000000000186115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  36.73 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  32.44 
 
 		 528 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.81 
 
 		 529 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  29.64 
 
 		 534 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 529 aa  246  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  29.27 
 
 		 534 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  29.27 
 
 		 534 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.53 
 
 		 536 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 529 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  29.64 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  29.08 
 
 		 534 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.36 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.9 
 
 		 521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  28.89 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  28.89 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  28.71 
 
 		 534 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.51 
 
 		 538 aa  239  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.02 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.97 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  32.11 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.38 
 
 		 542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.57 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  30.58 
 
 		 533 aa  233  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  31.85 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  31.48 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.41 
 
 		 532 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 536 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  28.32 
 
 		 536 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  27.94 
 
 		 536 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.99 
 
 		 553 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 536 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  28.6 
 
 		 536 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  31.38 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 534 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  27.85 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  27.75 
 
 		 533 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.37 
 
 		 525 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  28.87 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  29.56 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  29.92 
 
 		 543 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.76 
 
 		 527 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.31 
 
 		 540 aa  213  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  29.71 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  29.71 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  29.71 
 
 		 543 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.22 
 
 		 526 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  29.71 
 
 		 543 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.4 
 
 		 525 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.67 
 
 		 569 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000208522 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.54 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  28.54 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  28.54 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  28.54 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  28.38 
 
 		 543 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.36 
 
 		 525 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  28.38 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.36 
 
 		 525 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.64 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1162  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.92 
 
 		 528 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.308176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35 
 
 		 519 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  34.13 
 
 		 536 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1347  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.25 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3731  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.61 
 
 		 532 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.95506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.3 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0511  sensor histidine kinase  25.97 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.41 
 
 		 537 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3378  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.68 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.960766  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0638  sensor histidine kinase DpiB  29.23 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.736103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.41 
 
 		 537 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0500  sensor histidine kinase  25.82 
 
 		 516 aa  190  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.41 
 
 		 537 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.41 
 
 		 537 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0670  sensor histidine kinase DpiB  29.04 
 
 		 552 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0246714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0642  sensor histidine kinase DpiB  29.04 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0459667  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.41 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0707  sensor histidine kinase DpiB  29.23 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.77 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>