More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  69.86 
 
 		 220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  56.16 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  56.16 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  56.16 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  55.4 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  55.87 
 
 		 220 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  54.46 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  55.4 
 
 		 222 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  51.89 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  50.7 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  48.6 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  48.6 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  52.53 
 
 		 225 aa  208  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  47.89 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  46.95 
 
 		 217 aa  204  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  48.1 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  49.52 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  49.77 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 219 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  45.71 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  45.71 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  44.75 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  39.46 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  43.6 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  38.99 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.07 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.52 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  40.85 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.74 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  42.47 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.16 
 
 		 226 aa  148  8e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  31.22 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.3 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  31.56 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  32.3 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  28.77 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4545  phosphate uptake regulator, PhoU  33.16 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  25.46 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.89 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  27.36 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  25.59 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  26.15 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  27.1 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  25.59 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  29.02 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 		 226 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  27.23 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.85 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.19 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  29.38 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  26.19 
 
 		 213 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  29.68 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.63 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.63 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.91 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  30.91 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  28.19 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  24.64 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  30.24 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.77 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>