More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 892 aa  1796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.31 
 
 		 1029 aa  185  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  30.26 
 
 		 841 aa  181  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  49.47 
 
 		 664 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  47.21 
 
 		 407 aa  172  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  54.49 
 
 		 316 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  48.62 
 
 		 595 aa  165  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  30.41 
 
 		 999 aa  162  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  30.41 
 
 		 999 aa  162  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  29.27 
 
 		 999 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  45.16 
 
 		 306 aa  158  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  45.02 
 
 		 654 aa  158  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.22 
 
 		 945 aa  157  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 		 1505 aa  151  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.63 
 
 		 846 aa  143  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.39 
 
 		 1132 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  26.95 
 
 		 1135 aa  144  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  27.26 
 
 		 712 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  23.63 
 
 		 1081 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.57 
 
 		 1657 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  44.15 
 
 		 351 aa  131  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  22.84 
 
 		 918 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.81 
 
 		 1200 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  26.52 
 
 		 1143 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  38.3 
 
 		 695 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  36.52 
 
 		 928 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  26.33 
 
 		 941 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  33.85 
 
 		 1040 aa  117  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  42.71 
 
 		 322 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.54 
 
 		 953 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  24.62 
 
 		 972 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  27.38 
 
 		 422 aa  114  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  36.28 
 
 		 967 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.43 
 
 		 450 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  36.89 
 
 		 617 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.77 
 
 		 442 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  24.6 
 
 		 909 aa  108  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  39.77 
 
 		 546 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  29.92 
 
 		 342 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  29.44 
 
 		 419 aa  105  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.27 
 
 		 396 aa  105  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  39.29 
 
 		 396 aa  104  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.38 
 
 		 1142 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  37.56 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.69 
 
 		 387 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  22.64 
 
 		 918 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  54.37 
 
 		 300 aa  102  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  33.65 
 
 		 780 aa  101  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.61 
 
 		 1151 aa  101  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  24.14 
 
 		 984 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.04 
 
 		 388 aa  97.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.73 
 
 		 585 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.99 
 
 		 414 aa  94.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  27.81 
 
 		 461 aa  92.8  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4395  glucose sorbosone dehydrogenase  28.18 
 
 		 377 aa  90.9  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  25.98 
 
 		 396 aa  90.1  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.48 
 
 		 460 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  21.78 
 
 		 1182 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.24 
 
 		 2172 aa  89.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 410 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  27.99 
 
 		 371 aa  89.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.3 
 
 		 1138 aa  88.6  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  28.94 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.87 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  30.16 
 
 		 376 aa  86.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  28.81 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5321  dehydrogenase  26.64 
 
 		 376 aa  86.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  28.71 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.6 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.82 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6298  hypothetical protein  25.34 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  28.12 
 
 		 385 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  26.91 
 
 		 263 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.94 
 
 		 809 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.71 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32310  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.95 
 
 		 400 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.196723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1116  hypothetical protein  29.31 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0131047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.62 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.24 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  26.18 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  40.16 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  35.29 
 
 		 205 aa  80.5  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  34.74 
 
 		 867 aa  80.9  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.58 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.58 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.22 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  26.61 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  23.66 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  29.31 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  21.23 
 
 		 908 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  24.65 
 
 		 561 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  31.53 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2766  glucose sorbosone dehydrogenase  28.33 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  29.96 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  29.91 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  25.43 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  31.44 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>