185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  100 
 
 		 432 aa  843    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.62 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.88 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.5 
 
 		 454 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.26 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.89 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  54.31 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.33 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  52.56 
 
 		 444 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.3 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.71 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.89 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.69 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  52.45 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  48.6 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  47.92 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  48.95 
 
 		 443 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.12 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  48.6 
 
 		 443 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.37 
 
 		 444 aa  342  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.92 
 
 		 456 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.25 
 
 		 457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  47.1 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.22 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.19 
 
 		 444 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  40.14 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.35 
 
 		 444 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.52 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  40.67 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  40.78 
 
 		 447 aa  309  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  42.82 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  40.14 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  45.03 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  38.84 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  39.39 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  39.39 
 
 		 447 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.42 
 
 		 477 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  39.16 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  39.16 
 
 		 447 aa  289  8e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  39.16 
 
 		 447 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  39.16 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  39.16 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  38.93 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  38.93 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  38.93 
 
 		 447 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  38.8 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  36.51 
 
 		 446 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  36.28 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  40.33 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  39.73 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  37.64 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  37.67 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  43.02 
 
 		 491 aa  273  6e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  38 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  38.64 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  36.05 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  36.28 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  40.19 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  36.51 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000278373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  36.51 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  36.51 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.66 
 
 		 417 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  39.22 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  36.51 
 
 		 454 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  34.94 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  35.58 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  35.81 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  36.3 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  38.13 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  34.16 
 
 		 447 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  38.66 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.51 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  40.09 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.16 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.72 
 
 		 453 aa  247  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  38.6 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  36.43 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  36.24 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  32.35 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  38.5 
 
 		 443 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  37.2 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  38.53 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  35.88 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  38.07 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  37.13 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  36.47 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.03 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  34.85 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.09 
 
 		 447 aa  237  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  36.18 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  36.2 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  36.14 
 
 		 454 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  36.14 
 
 		 454 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.1 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  33.48 
 
 		 586 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  34.15 
 
 		 586 aa  226  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.57 
 
 		 454 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1274  cation transporter  40 
 
 		 442 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  32.95 
 
 		 467 aa  223  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>