206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  37.32 
 
 
285 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  36.75 
 
 
303 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  37.01 
 
 
296 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.16 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
293 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  33.7 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  34.51 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  35.38 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 
291 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  34.03 
 
 
287 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  33.7 
 
 
294 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  35.09 
 
 
283 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  33.1 
 
 
301 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 
285 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  31.29 
 
 
284 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  33.22 
 
 
295 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  31.06 
 
 
302 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  34.63 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  32.98 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  30.82 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.87 
 
 
300 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 
287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  32.01 
 
 
303 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  30.82 
 
 
291 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  33.1 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 
291 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  30.42 
 
 
291 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 
280 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.45 
 
 
284 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 
278 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  33.84 
 
 
280 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.69 
 
 
278 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.82 
 
 
281 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  33.11 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  34.11 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  33.08 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  32.3 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  31.6 
 
 
292 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.37 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  32.22 
 
 
288 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.97 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  29.25 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  30.8 
 
 
310 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  28.67 
 
 
284 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  30.77 
 
 
288 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  32.96 
 
 
289 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  29.71 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  29.39 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  32.96 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  31.92 
 
 
287 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  28.28 
 
 
410 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.2 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  31.67 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.7 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  29.58 
 
 
308 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  29.43 
 
 
287 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  31.07 
 
 
301 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  32.2 
 
 
282 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  32.27 
 
 
299 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  34.38 
 
 
262 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  28.39 
 
 
328 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  29.93 
 
 
301 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  30.45 
 
 
287 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  28.83 
 
 
287 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 
282 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  29.18 
 
 
278 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  29.18 
 
 
284 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 
278 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  29.96 
 
 
278 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  29.96 
 
 
286 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 
291 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 
290 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  28.67 
 
 
285 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  25.89 
 
 
270 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  29.64 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2127  helix-turn-helix domain protein  29.56 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  27.82 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4751  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264271  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 
281 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  28.35 
 
 
267 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  25.87 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5040  transcriptional regulator, XRE family  26.22 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.727846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  30.16 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12010  predicted transcription factor, MBF1 like protein  29.89 
 
 
284 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  28.33 
 
 
314 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0414  helix-turn-helix domain protein  28.81 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0254314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  33.02 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  28.32 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  26.99 
 
 
281 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 
290 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  29.89 
 
 
302 aa  89  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>