136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  100 
 
 		 83 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  56.67 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  53.33 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  47.06 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  48.39 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  48.33 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  49.15 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  50.82 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  43.66 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  47.62 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  46.55 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  48.44 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  47.46 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  42.67 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  47.46 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  49.15 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  47.54 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  44.78 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  46.38 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  52.73 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  45.76 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  47.46 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  44.62 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  40.98 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  40.98 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  51.92 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  43.1 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  50.91 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  48.89 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  53.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  53.06 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  48.89 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  41.43 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  49.12 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  32.81 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  42.67 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  53.23 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  45.76 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  46.3 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  50.94 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  53.06 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  47.37 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  43.33 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  51.02 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  42.86 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  43.1 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  46.43 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  39.06 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  40.74 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  34.25 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  36.21 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  48.98 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  41.51 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  34.78 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  36.51 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  46.43 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  39.06 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  39.66 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  35.94 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  31.25 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>