More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  100 
 
 		 118 aa  228  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  63.39 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  55.26 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  66.34 
 
 		 125 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  57.69 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  60.64 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0672  hypothetical protein  53.64 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0202  hypothetical protein  73.33 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  55.68 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9028  hypothetical protein  58.12 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  48.6 
 
 		 100 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  47.66 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  47.17 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  47.17 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  48.45 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3531  hypothetical protein  60 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.720072 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  42.98 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.12 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  46.59 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  44.68 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  43.16 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  43.3 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  45.36 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5272  hypothetical protein  58 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13748  hypothetical protein  57.53 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.348639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  45.36 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  42.59 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4904  hypothetical protein  58 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193926  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  42.59 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4993  hypothetical protein  58 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  43.43 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  42.71 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  47.73 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  37.96 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  42.16 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  39.18 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  42.45 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  43.82 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  38.1 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  41.67 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.44 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  43.48 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  38.46 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1446  hypothetical protein  37.39 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  41.84 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1287  hypothetical protein  56.38 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  41.51 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  44.94 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  43.27 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5528  hypothetical protein  55.32 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.54 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  44.09 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  39.36 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  37.84 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  42.7 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  39.8 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  39.42 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  44.04 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  44.04 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  41.3 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  36.61 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4574  hypothetical protein  43.69 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  37.27 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  46.43 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  42.45 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9314  hypothetical protein  55.13 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  38.74 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  40.4 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  37.96 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  40.38 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  40.43 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  40.95 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>