83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36140 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 419 aa  797    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  62.97 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  37.87 
 
 		 407 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  31 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 412 aa  133  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  29.38 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  31.23 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 		 403 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 417 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  24.39 
 
 		 407 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  30.13 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  29.87 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 390 aa  100  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  32.36 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  33.14 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 425 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  31.41 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  32.27 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0745  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  24.49 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  30.88 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  26.58 
 
 		 1019 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  28.71 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  31.35 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  21.88 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  26.52 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  27.18 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.39 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2304  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 452 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000298214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2572  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 469 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  30.54 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  29.59 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.31 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>