More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  100 
 
 		 394 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  62.09 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.4 
 
 		 397 aa  330  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  47.83 
 
 		 395 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  47.83 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  47.83 
 
 		 395 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  47.09 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  44.5 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.78 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  45.52 
 
 		 397 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  45.66 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.18 
 
 		 392 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  47.96 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  45.8 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  41.01 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.78 
 
 		 393 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  41.07 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.23 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  41.48 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  40.84 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  39.37 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.96 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  37.08 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  41.27 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.17 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.91 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.42 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.19 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  33.5 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.93 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  29.89 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.82 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.98 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  34.39 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  34.39 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  34.93 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  34.93 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  33.86 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  35.81 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  31.91 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  37.74 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  36.08 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  30.77 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  36.08 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  34.64 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.98 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  34.64 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  33.33 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  38.19 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  28.19 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  34.22 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  31.33 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.69 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  35.42 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.21 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.97 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  34.66 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.45 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.18 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  39.74 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  33.11 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  34.48 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  29.12 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.83 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  34.48 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  34.66 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  37.58 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  40 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  33.96 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  33.33 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.13 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  33.33 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  33.33 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  36.63 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  32.43 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  30.61 
 
 		 500 aa  67  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.65 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11061  hypothetical protein  34.13 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0731  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.21 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.86 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.28 
 
 		 476 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.84 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  36.55 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  30.69 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  39.61 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  32.48 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  33.14 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  37.42 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  30.11 
 
 		 264 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  32.7 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  39.16 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.67 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  29.94 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  36.31 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  31.38 
 
 		 515 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  29.94 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  29.94 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.6 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>