More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 463 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 459 aa  943    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  67.6 
 
 		 464 aa  653    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 481 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  63.7 
 
 		 465 aa  590  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 481 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 481 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 467 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 463 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  60.83 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 467 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  61.77 
 
 		 467 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  60.13 
 
 		 465 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  59.4 
 
 		 464 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 480 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 471 aa  508  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 481 aa  460  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 524 aa  435  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 487 aa  435  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 549 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  43.07 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 485 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 505 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 494 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 461 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 474 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 455 aa  368  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 485 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 468 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>