More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  58.01 
 
 
741 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  55.21 
 
 
728 aa  694    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  57.14 
 
 
737 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  50.73 
 
 
749 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  56.44 
 
 
733 aa  734    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  68.55 
 
 
734 aa  892    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  100 
 
 
747 aa  1432    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  54.28 
 
 
750 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  57.8 
 
 
741 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  57.85 
 
 
729 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  57.8 
 
 
741 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  58.1 
 
 
742 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  55.32 
 
 
748 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.93 
 
 
721 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.78 
 
 
732 aa  422  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.25 
 
 
718 aa  420  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.65 
 
 
731 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.61 
 
 
731 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.97 
 
 
731 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.8 
 
 
723 aa  399  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.48 
 
 
754 aa  399  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.86 
 
 
731 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.21 
 
 
735 aa  393  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.44 
 
 
759 aa  391  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  32.5 
 
 
754 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.38 
 
 
760 aa  392  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.46 
 
 
736 aa  391  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.67 
 
 
768 aa  392  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.98 
 
 
727 aa  391  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.49 
 
 
754 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.03 
 
 
808 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.59 
 
 
743 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.25 
 
 
719 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.43 
 
 
769 aa  383  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 
810 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.64 
 
 
757 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.64 
 
 
756 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.32 
 
 
742 aa  379  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.64 
 
 
740 aa  379  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.98 
 
 
806 aa  379  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.28 
 
 
755 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.24 
 
 
738 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.15 
 
 
739 aa  379  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.42 
 
 
737 aa  378  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.97 
 
 
738 aa  377  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.74 
 
 
742 aa  375  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.64 
 
 
754 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.51 
 
 
740 aa  374  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.27 
 
 
781 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.27 
 
 
784 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.98 
 
 
737 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  32.01 
 
 
764 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.6 
 
 
781 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.7 
 
 
736 aa  363  6e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.55 
 
 
754 aa  362  9e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.95 
 
 
757 aa  363  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  31.95 
 
 
713 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.64 
 
 
757 aa  357  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  30.54 
 
 
775 aa  352  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.02 
 
 
704 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  30.67 
 
 
763 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  39.89 
 
 
803 aa  347  4e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.48 
 
 
701 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.6 
 
 
763 aa  347  6e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.22 
 
 
738 aa  345  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.17 
 
 
772 aa  344  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.62 
 
 
715 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.01 
 
 
773 aa  343  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  34.57 
 
 
703 aa  343  9e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  30.31 
 
 
814 aa  340  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.21 
 
 
718 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  38.43 
 
 
550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.73 
 
 
804 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  34.83 
 
 
722 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.27 
 
 
852 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.15 
 
 
730 aa  337  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  38.03 
 
 
788 aa  336  9e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  29.96 
 
 
829 aa  333  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.83 
 
 
801 aa  332  2e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.79 
 
 
753 aa  325  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  33.42 
 
 
739 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  37.68 
 
 
732 aa  324  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  31.7 
 
 
746 aa  322  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  31.94 
 
 
810 aa  316  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  39.2 
 
 
567 aa  316  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  31 
 
 
721 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  33.52 
 
 
703 aa  313  6.999999999999999e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.61 
 
 
709 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  39.2 
 
 
601 aa  313  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  33.98 
 
 
699 aa  312  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  34.25 
 
 
806 aa  311  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.54 
 
 
801 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  38.95 
 
 
613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  34.96 
 
 
639 aa  309  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.4 
 
 
805 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.48 
 
 
805 aa  308  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  35.68 
 
 
691 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.17 
 
 
810 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  33.76 
 
 
776 aa  301  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.88 
 
 
804 aa  297  5e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>