More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  100 
 
 
749 aa  1494    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  51.2 
 
 
271 aa  240  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  34.19 
 
 
827 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
340 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1024  glycosyl transferase family 2  44.49 
 
 
268 aa  169  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.708512  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
340 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
347 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 
353 aa  160  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  32.74 
 
 
496 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
340 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  31.29 
 
 
509 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  29.4 
 
 
497 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  32.64 
 
 
589 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  33.75 
 
 
471 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  36.16 
 
 
449 aa  142  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  30.4 
 
 
485 aa  138  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  31.52 
 
 
462 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  31.91 
 
 
468 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  32.83 
 
 
507 aa  130  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  32 
 
 
562 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  31.77 
 
 
532 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
253 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  30.5 
 
 
493 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  33.91 
 
 
547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
232 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
321 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
228 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
344 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
228 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
319 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
229 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
237 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  29.61 
 
 
352 aa  102  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
327 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
253 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
252 aa  101  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
229 aa  100  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 
245 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 
245 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
245 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
333 aa  99.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
229 aa  99  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  35.18 
 
 
357 aa  99  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  33.5 
 
 
260 aa  98.6  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
226 aa  98.6  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
226 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
321 aa  98.2  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
340 aa  97.4  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  29.26 
 
 
333 aa  97.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
349 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  28.07 
 
 
328 aa  95.5  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
228 aa  93.6  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
287 aa  93.6  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
243 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  36.1 
 
 
233 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
357 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
242 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
336 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
243 aa  91.3  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.77 
 
 
321 aa  90.9  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  29.33 
 
 
245 aa  90.9  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 
243 aa  90.5  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
242 aa  90.5  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
242 aa  89.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
250 aa  89.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
345 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
237 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
226 aa  89  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  29.9 
 
 
234 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 
295 aa  88.6  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
355 aa  88.2  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
362 aa  87.8  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
448 aa  87.8  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.31 
 
 
220 aa  87.4  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
250 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
230 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.44 
 
 
238 aa  87  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
346 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
293 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
411 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
227 aa  85.9  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
233 aa  85.1  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
236 aa  83.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
291 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
374 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
236 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
229 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
320 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
242 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
313 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  32.14 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
235 aa  82.4  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>