More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  72.4 
 
 		 257 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  38.15 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9121  putative transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.25 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0856057  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1078  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 245 aa  85.5  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358733  hitchhiker  0.00355085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0011  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0717  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4811  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.32 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  23.98 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  29.51 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.95 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.95 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.51 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.3 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  25.4 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  25.4 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.13 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>