More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 522 aa  1003    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  61.86 
 
 		 538 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  59.05 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  59.53 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  60.48 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  57.52 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  54.83 
 
 		 517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  55.12 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  57.26 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  56.8 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  59.27 
 
 		 502 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0941  FAD dependent oxidoreductase  55.8 
 
 		 555 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0194279  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  52.73 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  55.31 
 
 		 523 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3372  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.581331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3383  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3434  FAD dependent oxidoreductase  54.74 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4837  FAD dependent oxidoreductase  52.76 
 
 		 510 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  51.31 
 
 		 529 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 		 572 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.71 
 
 		 525 aa  286  9e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 573 aa  279  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.2 
 
 		 585 aa  276  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  43.83 
 
 		 639 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.25 
 
 		 605 aa  273  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 603 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 574 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 600 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 525 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  40.17 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  41.89 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  40.08 
 
 		 573 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.41 
 
 		 530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  38.91 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  40.25 
 
 		 567 aa  259  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 		 519 aa  260  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 568 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 566 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 583 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  38.51 
 
 		 559 aa  257  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.58 
 
 		 554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 595 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 		 524 aa  253  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 543 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 		 582 aa  253  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 552 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 560 aa  247  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 569 aa  247  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 		 582 aa  245  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 559 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  40.74 
 
 		 567 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.16 
 
 		 587 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 536 aa  243  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 562 aa  243  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 581 aa  243  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 537 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 		 519 aa  240  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 537 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 559 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 546 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 582 aa  236  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 		 534 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.01 
 
 		 545 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 518 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  39.02 
 
 		 585 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  39.77 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 		 583 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 529 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 579 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.15 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 579 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 579 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 593 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  39.09 
 
 		 528 aa  226  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  40.16 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 543 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  38.82 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 		 581 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  37.02 
 
 		 550 aa  213  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1035  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  38.48 
 
 		 602 aa  212  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>