More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 534 aa  1058    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  50.57 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  51.36 
 
 		 527 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  48.86 
 
 		 528 aa  422  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  49.25 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  49.25 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  49.25 
 
 		 525 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.51 
 
 		 521 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  50.38 
 
 		 550 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  47.42 
 
 		 529 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  53.29 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.07 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  48.02 
 
 		 545 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  51.16 
 
 		 521 aa  395  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  49.59 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.08 
 
 		 518 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.01 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  44.25 
 
 		 520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  40.33 
 
 		 556 aa  353  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  45.83 
 
 		 531 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.12 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  37.57 
 
 		 552 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 		 531 aa  312  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  36.54 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  36.33 
 
 		 538 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  38.06 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  36.18 
 
 		 583 aa  296  9e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  34.78 
 
 		 559 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 		 565 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  37.12 
 
 		 584 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.77 
 
 		 534 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  38.06 
 
 		 531 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.88 
 
 		 568 aa  276  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.93 
 
 		 557 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.5 
 
 		 579 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.51 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  39.79 
 
 		 546 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 		 564 aa  226  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  32.44 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.81 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  34.69 
 
 		 527 aa  203  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.51 
 
 		 535 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.77 
 
 		 536 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.5 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  31.6 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  32.35 
 
 		 534 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 		 516 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  31.51 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  34.25 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  32.31 
 
 		 517 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  32.47 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  33 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  31.77 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  29.2 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  29.2 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  29.2 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  32.07 
 
 		 470 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  29.42 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  29.42 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  30.54 
 
 		 513 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  29.42 
 
 		 484 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  29.42 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.29 
 
 		 554 aa  170  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  28.51 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.11 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.51 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.39 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  29.39 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.98 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.98 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.18 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.24 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.78 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.78 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.39 
 
 		 470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.98 
 
 		 470 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.45 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 		 472 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.93 
 
 		 496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.94 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.18 
 
 		 470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.9 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.87 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.89 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.25 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  25.15 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  28.99 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 		 474 aa  123  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.11 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.28 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>