More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
509 aa  1035  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  44.77 
 
 
807 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 
517 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  43.14 
 
 
550 aa  336  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  38.14 
 
 
547 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3532  AMP-binding enzyme  40.9 
 
 
554 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.291256  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3175  AMP-dependent synthetase and ligase  41.18 
 
 
554 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2837  AMP-dependent synthetase and ligase  40.78 
 
 
554 aa  320  4e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.336629  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 
534 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.81 
 
 
534 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3237  ATP-dependent AMP-binding family protein  36.8 
 
 
538 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.402279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2539  putative acyl-CoA synthetase  37.92 
 
 
546 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.389975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 
541 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2677  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
544 aa  283  4e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1334  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
538 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149861  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
520 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.73 
 
 
517 aa  267  3e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
551 aa  266  9e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 
525 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
544 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
512 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
630 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
568 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.21 
 
 
538 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0079  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  32.05 
 
 
517 aa  260  5e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.187597  normal  0.982419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
520 aa  259  8e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.66 
 
 
517 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.672086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0077  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.85 
 
 
517 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.26 
 
 
517 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.93 
 
 
518 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.46 
 
 
517 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
513 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  36.69 
 
 
550 aa  255  1e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.54 
 
 
517 aa  255  1e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
521 aa  254  2e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
514 aa  254  2e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.68 
 
 
522 aa  255  2e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0038  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.98 
 
 
517 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.565789  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0039  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.49 
 
 
522 aa  253  5e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.95 
 
 
516 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0041  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.6 
 
 
517 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3618  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.4 
 
 
505 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00040  hypothetical protein  31.43 
 
 
522 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00041  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  31.43 
 
 
522 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.88 
 
 
513 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
490 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6181  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
537 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.93 
 
 
545 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
527 aa  249  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
499 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3562  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 
517 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 
662 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 
576 aa  246  7e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  37.61 
 
 
535 aa  246  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 
527 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.68 
 
 
512 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
576 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 
571 aa  244  2e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
576 aa  244  2e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
576 aa  244  2e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
576 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
576 aa  244  2e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
570 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  34.71 
 
 
571 aa  243  4e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 
532 aa  243  4e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
576 aa  243  4e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 
571 aa  243  8e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
549 aa  243  8e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 
552 aa  242  9e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.62 
 
 
518 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 
527 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 
576 aa  242  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 
532 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.21 
 
 
555 aa  239  7e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  34.09 
 
 
570 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
535 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
492 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  34.66 
 
 
537 aa  239  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 
561 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.51 
 
 
552 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 
575 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
512 aa  237  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 
560 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  34.03 
 
 
576 aa  237  5e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
552 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
509 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 
544 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 
552 aa  235  1e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.9 
 
 
575 aa  236  1e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.53 
 
 
503 aa  235  1e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  32.45 
 
 
548 aa  234  2e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 
565 aa  234  2e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
539 aa  235  2e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 
521 aa  235  2e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 
575 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 
575 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
501 aa  235  2e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 
575 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 
575 aa  234  4e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
553 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>