More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32210 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
318 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  62.26 
 
 
320 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  60.75 
 
 
318 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  61.49 
 
 
326 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  62.5 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  57.89 
 
 
319 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  58.44 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  58.44 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  58.44 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  57.59 
 
 
322 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  55.32 
 
 
311 aa  286  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  54.4 
 
 
318 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  54.57 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  53.31 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  52.89 
 
 
326 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  54.66 
 
 
319 aa  282  6.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  52.89 
 
 
331 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  53.94 
 
 
323 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  52.96 
 
 
315 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  54.23 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  52.41 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  53.73 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  51.9 
 
 
321 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  53.09 
 
 
308 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  53.89 
 
 
330 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  49.56 
 
 
353 aa  269  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  52.19 
 
 
328 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  50.16 
 
 
312 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  53.29 
 
 
318 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  51.86 
 
 
318 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  50.77 
 
 
327 aa  255  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  49.39 
 
 
328 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  50.15 
 
 
532 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  50 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  44 
 
 
568 aa  223  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  45.09 
 
 
333 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13480  Ppx/GppA phosphatase  48.22 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  47.65 
 
 
308 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  45.23 
 
 
307 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  34.5 
 
 
301 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  44.3 
 
 
305 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  35.76 
 
 
305 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  41.22 
 
 
311 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  38.04 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  38.82 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  37.74 
 
 
326 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  34.39 
 
 
305 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  38.94 
 
 
310 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  44.3 
 
 
305 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  38.81 
 
 
312 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 
317 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0658  Ppx/GppA phosphatase  43.99 
 
 
305 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  39.93 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  36.93 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03920  exopolyphosphatase  33.15 
 
 
359 aa  142  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.20783 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  33.57 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  34.15 
 
 
311 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  34.7 
 
 
288 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  32.91 
 
 
501 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  34.27 
 
 
312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  34.25 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  33.96 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0128  Ppx/GppA phosphatase  33.92 
 
 
347 aa  133  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  32.92 
 
 
539 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  32.71 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  33.54 
 
 
513 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  32.87 
 
 
505 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  33.13 
 
 
435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0077  Ppx/GppA phosphatase  31.35 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0183258  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  34.23 
 
 
446 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  35.29 
 
 
363 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  37.74 
 
 
307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0084  Ppx/GppA phosphatase  36.22 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  33.56 
 
 
550 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  33.85 
 
 
603 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  33.65 
 
 
548 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  32.38 
 
 
502 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 
500 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 
500 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  31.99 
 
 
520 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3006  Ppx/GppA phosphatase  36.33 
 
 
512 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0641  Ppx/GppA family phosphatase  32.04 
 
 
498 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0251449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2062  Ppx/GppA phosphatase  36.62 
 
 
303 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  32.63 
 
 
375 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0372  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
509 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1516  Ppx/GppA phosphatase  32.31 
 
 
376 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219937  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  31.87 
 
 
532 aa  122  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  32.99 
 
 
501 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  30.24 
 
 
531 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0685  Ppx/GppA family phosphatase  31.74 
 
 
498 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  30.19 
 
 
531 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1170  Ppx/GppA phosphatase  33.23 
 
 
373 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.854732  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  30.5 
 
 
531 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.81 
 
 
544 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  31.75 
 
 
545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  29.71 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.81 
 
 
544 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  31.49 
 
 
502 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0659  Ppx/GppA phosphatase  31.37 
 
 
367 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0244  exopolyphosphatase  31.32 
 
 
321 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>