More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 498 aa  981    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.88 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  45.77 
 
 		 583 aa  362  8e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  41.01 
 
 		 469 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  46.72 
 
 		 475 aa  342  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 534 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  43 
 
 		 508 aa  326  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  44.74 
 
 		 515 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  41.01 
 
 		 555 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 537 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  44.32 
 
 		 508 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  38.99 
 
 		 517 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  36.42 
 
 		 491 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  35.99 
 
 		 507 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 544 aa  273  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  33.8 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2684  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7131  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.5 
 
 		 521 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  41.39 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 504 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  37.94 
 
 		 477 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 469 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  37.79 
 
 		 481 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.79 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 459 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 469 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 452 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  36.86 
 
 		 487 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  32.53 
 
 		 461 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  37.54 
 
 		 343 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  35.46 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 474 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  38.12 
 
 		 505 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  32.35 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 470 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 524 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 601 aa  157  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.28 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  39.87 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  40.06 
 
 		 490 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.1 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  35.14 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.69 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  34.76 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 406 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 545 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  27.71 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.85 
 
 		 310 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.04 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  29.08 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.25 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 471 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  39.33 
 
 		 454 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 513 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 460 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3266  histidine kinase  33.11 
 
 		 476 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  33.81 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  39.19 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  37.92 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.61 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 489 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  30.67 
 
 		 503 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  38.67 
 
 		 389 aa  143  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 463 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 463 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  37.19 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  35.69 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.04 
 
 		 496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  36.39 
 
 		 480 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>