More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.65 
 
 		 220 aa  348  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  71.89 
 
 		 219 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3167  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.69 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.436774  normal  0.0676898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  69.27 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  69.27 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.59 
 
 		 219 aa  300  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5704  two component transcriptional regulator  73.27 
 
 		 220 aa  299  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.27 
 
 		 220 aa  297  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  64.55 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  65.3 
 
 		 220 aa  281  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.71 
 
 		 228 aa  277  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4935  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.69 
 
 		 221 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  65.32 
 
 		 223 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.71 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21520  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.21 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0794896  hitchhiker  0.0000630157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2869  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.47 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.3 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2685  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.12 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2593  two component transcriptional regulator, winged helix family  55 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3524  two component transcriptional regulator, winged helix family  55 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.78 
 
 		 227 aa  238  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.88 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.14 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  50.22 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  48.21 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  48 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 224 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4710  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  46.85 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.61 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  49.1 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.05 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  47.3 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.86 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  43.18 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 240 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  49.77 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 233 aa  187  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  46.02 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  48.65 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  48.65 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.89 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  48.65 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.05 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  48.65 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  48.65 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>