More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  100 
 
 		 547 aa  1027    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.19 
 
 		 547 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.67 
 
 		 565 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  54.5 
 
 		 592 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 		 544 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 		 569 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  50.19 
 
 		 551 aa  364  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 		 540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  49.81 
 
 		 576 aa  350  4e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.72 
 
 		 601 aa  346  7e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.92 
 
 		 532 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 		 564 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 		 606 aa  208  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 		 663 aa  180  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 		 634 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 		 597 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.25 
 
 		 515 aa  154  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 		 550 aa  152  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 		 509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.87 
 
 		 510 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.25 
 
 		 563 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 		 569 aa  114  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  25.09 
 
 		 741 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 		 560 aa  111  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  25.09 
 
 		 741 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  24.75 
 
 		 509 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 		 530 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.34 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.76 
 
 		 561 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.25 
 
 		 677 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.15 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.68 
 
 		 741 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  25.52 
 
 		 535 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.23 
 
 		 743 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  25.74 
 
 		 535 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.3 
 
 		 740 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  25.53 
 
 		 535 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 		 564 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  26.92 
 
 		 543 aa  100  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.75 
 
 		 742 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.69 
 
 		 579 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 		 741 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 758 aa  98.2  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.92 
 
 		 545 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.31 
 
 		 550 aa  97.1  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.39 
 
 		 569 aa  96.3  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.04 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  36.28 
 
 		 279 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  36.45 
 
 		 275 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  29.11 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  23.22 
 
 		 564 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.74 
 
 		 586 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 		 273 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.9 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.7 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  36.45 
 
 		 275 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.84 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.45 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  25.84 
 
 		 587 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 		 536 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  35.94 
 
 		 269 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.63 
 
 		 692 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.42 
 
 		 284 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  24.95 
 
 		 530 aa  90.5  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  22.92 
 
 		 516 aa  90.5  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.85 
 
 		 575 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.036888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.54 
 
 		 277 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  34.54 
 
 		 277 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  23.38 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.54 
 
 		 277 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.54 
 
 		 277 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  25.09 
 
 		 575 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 		 589 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  33.5 
 
 		 275 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 692 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.46 
 
 		 276 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.37 
 
 		 574 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  35.29 
 
 		 284 aa  87.8  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 		 540 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.32 
 
 		 259 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.29 
 
 		 288 aa  87.8  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  22.27 
 
 		 516 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 		 277 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.21 
 
 		 277 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.21 
 
 		 277 aa  87.4  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.21 
 
 		 277 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.21 
 
 		 277 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3173  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.67 
 
 		 290 aa  87.4  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.61 
 
 		 543 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  22.04 
 
 		 514 aa  87  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.46 
 
 		 559 aa  87  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  24.63 
 
 		 574 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  32.29 
 
 		 288 aa  87  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.8 
 
 		 278 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.76 
 
 		 279 aa  86.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 551 aa  86.7  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.7 
 
 		 273 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>