More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  71.71 
 
 		 455 aa  648    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  76.5 
 
 		 450 aa  681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  100 
 
 		 451 aa  909    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  70.04 
 
 		 453 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  69.76 
 
 		 454 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  71.9 
 
 		 449 aa  611  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  67.26 
 
 		 456 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  69.09 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  69.91 
 
 		 450 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  66.22 
 
 		 452 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  67.7 
 
 		 454 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  67.63 
 
 		 453 aa  580  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  63.12 
 
 		 497 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  66.23 
 
 		 471 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  67.27 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  64.36 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  68.05 
 
 		 456 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  66.82 
 
 		 464 aa  557  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  65.23 
 
 		 461 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  64.88 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  65.54 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  64.88 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  64.88 
 
 		 465 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  60.43 
 
 		 475 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  60.26 
 
 		 472 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  60.71 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  62.14 
 
 		 469 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  62.64 
 
 		 454 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  60.08 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  60.45 
 
 		 502 aa  518  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  57.38 
 
 		 491 aa  498  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  64.03 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  58.33 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  56.67 
 
 		 451 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  54.85 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  52.68 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  50.43 
 
 		 592 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  44.07 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  44.74 
 
 		 447 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  45.83 
 
 		 813 aa  343  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  44.1 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  42.86 
 
 		 448 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  43.15 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  43.3 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  41.63 
 
 		 455 aa  328  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  43.17 
 
 		 450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  41.14 
 
 		 461 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  43.88 
 
 		 456 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  41.94 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  43.21 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  43.46 
 
 		 448 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  42.07 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  40.97 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  43.11 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  41.19 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  42.11 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  41.21 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  41.37 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  41.07 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  40.98 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  40.56 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  40.18 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  41.44 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  40.17 
 
 		 487 aa  302  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  38.24 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  40.43 
 
 		 456 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  38.56 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  40.18 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  40.31 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  37.8 
 
 		 497 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2172  phosphomannomutase  41.41 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.140706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  40.22 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  40.18 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  42.22 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  40.22 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  40.22 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  39.35 
 
 		 456 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  41 
 
 		 457 aa  295  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0835  phosphomannomutase  42.34 
 
 		 458 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  40 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  39.13 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  39.96 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  39.35 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  39.35 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  39.13 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  39.13 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  39.13 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  38.88 
 
 		 463 aa  292  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  38.91 
 
 		 456 aa  292  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2492  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.89 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.211242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  41.56 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  38.84 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  39.86 
 
 		 454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1900  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  41.61 
 
 		 456 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.662048  hitchhiker  0.0000555961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  40.65 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  39.42 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  37.5 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  40.18 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  40.85 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>