15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30430 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30430  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.154496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1024  hypothetical protein  60.47 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47673  normal  0.0221645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  56.92 
 
 		 322 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00670  hypothetical protein  56.15 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06380  hypothetical protein  56.15 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0254  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.58 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0069  hypothetical protein  55.56 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1012  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.67 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1537  hypothetical protein  50.39 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  51.88 
 
 		 352 aa  126  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.4 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09050  hypothetical protein  46.46 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2385  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.37 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.09 
 
 		 140 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1588  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 137 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>