198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  31.16 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  32.38 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  34.81 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  29.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 238 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  26.12 
 
 		 246 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  25.44 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  28.97 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  39.58 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  36.36 
 
 		 233 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 244 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 245 aa  44.7  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 235 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1513  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000721449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>