More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  100 
 
 
207 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4844  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 
212 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2223  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.37 
 
 
209 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  40.5 
 
 
211 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.65 
 
 
208 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
215 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
209 aa  128  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  33.33 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  31.22 
 
 
210 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 
209 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  33.49 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  31.4 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  31.4 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.84 
 
 
211 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  31.4 
 
 
210 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  31.4 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  31.4 
 
 
210 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30.73 
 
 
210 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
213 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2741  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.36 
 
 
217 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.98 
 
 
210 aa  121  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.73 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.02 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.21 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.74 
 
 
208 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000259292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  31.03 
 
 
208 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.74 
 
 
207 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  31.53 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.21 
 
 
208 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  30.39 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.06 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  30.54 
 
 
208 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.41 
 
 
214 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
208 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  34.21 
 
 
248 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
203 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.96 
 
 
207 aa  104  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  31.03 
 
 
208 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  31.03 
 
 
208 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 
208 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
207 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  34.57 
 
 
208 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  31.15 
 
 
210 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  34.05 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.05 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  34.21 
 
 
205 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 
207 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  31.07 
 
 
209 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.83 
 
 
209 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 
206 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  35.68 
 
 
221 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  38.27 
 
 
208 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 
213 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  32.2 
 
 
208 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
245 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.78 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165726  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.31 
 
 
218 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  38.3 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.82 
 
 
234 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.61 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.18 
 
 
211 aa  99  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  38.5 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  32.52 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.22 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  31.47 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2130  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  29.52 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.82 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.92 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 
218 aa  95.1  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
204 aa  94.7  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.35 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.02 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.69 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.15 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2381  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.73 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000868866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 
213 aa  92  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.376522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>