More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  58.23 
 
 		 664 aa  687    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  56.12 
 
 		 672 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  62.59 
 
 		 676 aa  746    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  63.68 
 
 		 706 aa  768    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  59.73 
 
 		 670 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  100 
 
 		 684 aa  1356    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  62.77 
 
 		 699 aa  794    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  64.12 
 
 		 677 aa  765    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  59.49 
 
 		 665 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  71.07 
 
 		 681 aa  956    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.86 
 
 		 694 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  59.49 
 
 		 665 aa  707    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  52.69 
 
 		 706 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  55.29 
 
 		 765 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  64.85 
 
 		 674 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  59.49 
 
 		 665 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.41 
 
 		 666 aa  708    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  52.28 
 
 		 683 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  51.76 
 
 		 699 aa  595  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  49.42 
 
 		 664 aa  588  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  49.71 
 
 		 690 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  51.22 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  52.85 
 
 		 728 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  51.05 
 
 		 696 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  51.46 
 
 		 676 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  49 
 
 		 685 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  50.44 
 
 		 673 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  66.95 
 
 		 844 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  51.15 
 
 		 679 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  47.77 
 
 		 699 aa  538  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  49.66 
 
 		 710 aa  524  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  47.31 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.14 
 
 		 660 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  36.19 
 
 		 649 aa  291  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  34.64 
 
 		 639 aa  290  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.87 
 
 		 643 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.9 
 
 		 960 aa  287  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.76 
 
 		 636 aa  286  7e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.54 
 
 		 633 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.89 
 
 		 646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.87 
 
 		 674 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.52 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.51 
 
 		 646 aa  281  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  33.04 
 
 		 707 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  34.29 
 
 		 647 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.85 
 
 		 646 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.4 
 
 		 644 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.38 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.38 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.38 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.38 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.95 
 
 		 651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.23 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.38 
 
 		 640 aa  275  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  34.66 
 
 		 673 aa  275  3e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.23 
 
 		 636 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  32.68 
 
 		 851 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  34.06 
 
 		 755 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.28 
 
 		 634 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  33.53 
 
 		 639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  31.53 
 
 		 662 aa  268  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  31.36 
 
 		 669 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  31.36 
 
 		 640 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  31.36 
 
 		 640 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  33.68 
 
 		 639 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  28.53 
 
 		 709 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.67 
 
 		 636 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  34.63 
 
 		 639 aa  266  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  31.46 
 
 		 669 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  33.8 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  34.17 
 
 		 649 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.64 
 
 		 634 aa  264  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  32.64 
 
 		 634 aa  264  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.64 
 
 		 634 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.52 
 
 		 636 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  31.18 
 
 		 664 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  33.44 
 
 		 636 aa  263  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  34.17 
 
 		 757 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.84 
 
 		 658 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  33.28 
 
 		 751 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.37 
 
 		 636 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.16 
 
 		 652 aa  259  8e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  32.54 
 
 		 876 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  32.8 
 
 		 755 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.01 
 
 		 652 aa  259  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  33.54 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  31.49 
 
 		 640 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  33.54 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  34.53 
 
 		 675 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.74 
 
 		 651 aa  258  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  33.77 
 
 		 749 aa  257  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.33 
 
 		 659 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.33 
 
 		 674 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.82 
 
 		 921 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  35.19 
 
 		 645 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>