More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  61.21 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  50.69 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  45.58 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  45.19 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  35.42 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  31.4 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 217 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1173  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  33.65 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5600  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2937  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279772  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  31.39 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  28.92 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  31.37 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  24.77 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.3 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>