58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  773    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  63.27 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  57.91 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  57.91 
 
 		 412 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  58.11 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  57.03 
 
 		 372 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  52.49 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  53.98 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  56.41 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  50.79 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  49.02 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  35.66 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  33.6 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  35.42 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  36.79 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  36.54 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  38.14 
 
 		 400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  35.59 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  34.35 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  35.68 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  35.33 
 
 		 438 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  36.83 
 
 		 423 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  34.78 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  35.84 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  33.16 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  36.81 
 
 		 428 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  35.21 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  33.74 
 
 		 487 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  35.07 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  35.01 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  32.67 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  29 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  39.21 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30.86 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  28.94 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.99 
 
 		 444 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.72 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  35.11 
 
 		 443 aa  93.6  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  29.47 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  27.35 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25.08 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  25.28 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  23.15 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  26.81 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  23.62 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  30.85 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  24.43 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  18.89 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  20.75 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  22.85 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  20.24 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  22.5 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  23.27 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  23.61 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  18.01 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  32.95 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>