More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  78.88 
 
 		 251 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  74.62 
 
 		 261 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  76.08 
 
 		 259 aa  398  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  76.49 
 
 		 251 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  76.52 
 
 		 256 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  76.61 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  76.61 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  78.6 
 
 		 244 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  74.5 
 
 		 258 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  77.69 
 
 		 242 aa  387  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  77.27 
 
 		 242 aa  384  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  75.1 
 
 		 247 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  76.54 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  74.5 
 
 		 262 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  74.49 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.62 
 
 		 257 aa  380  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  73.71 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  74.8 
 
 		 249 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  78.14 
 
 		 264 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  74.19 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  73.66 
 
 		 247 aa  378  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  71.71 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  75.31 
 
 		 257 aa  377  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  72.02 
 
 		 270 aa  374  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  78.28 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  74.3 
 
 		 250 aa  374  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  71.95 
 
 		 256 aa  371  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  74.79 
 
 		 242 aa  364  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.84 
 
 		 264 aa  361  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  68.98 
 
 		 252 aa  361  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  72.38 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  68.31 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  64.61 
 
 		 244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  61.04 
 
 		 249 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  61.83 
 
 		 257 aa  315  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  59.44 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.71 
 
 		 253 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  63.22 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61.89 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  59.92 
 
 		 249 aa  311  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  61.66 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  60.17 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.5 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  59.92 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  61.57 
 
 		 265 aa  309  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.26 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  61.26 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.43 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  61.26 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  60.64 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.08 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.88 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  61.67 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.92 
 
 		 242 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  58.57 
 
 		 252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.17 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  60.17 
 
 		 262 aa  307  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.75 
 
 		 262 aa  307  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.75 
 
 		 262 aa  307  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  60.87 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.75 
 
 		 252 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  61.25 
 
 		 253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  61.83 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.91 
 
 		 246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  61 
 
 		 246 aa  305  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.17 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  60.33 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.7 
 
 		 257 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  61.57 
 
 		 244 aa  304  7e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  59.51 
 
 		 268 aa  304  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.58 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  60.25 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  62.82 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.11 
 
 		 251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  57.37 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.5 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.84 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  58.68 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  60.25 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  61.16 
 
 		 245 aa  302  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  58.3 
 
 		 257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  60.83 
 
 		 254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  61.2 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  58.37 
 
 		 248 aa  301  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  62.82 
 
 		 273 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  63.22 
 
 		 257 aa  301  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.85 
 
 		 251 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  59.27 
 
 		 253 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  59.92 
 
 		 255 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  61.16 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 284 aa  301  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  60.16 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  60.83 
 
 		 242 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.85 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>