More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  100 
 
 		 482 aa  947    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  77.12 
 
 		 480 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  66.81 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  66.74 
 
 		 487 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  70.61 
 
 		 485 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.88 
 
 		 493 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  62.7 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  69.18 
 
 		 501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  66.31 
 
 		 479 aa  571  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  67.24 
 
 		 494 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  64.88 
 
 		 503 aa  564  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  64.02 
 
 		 484 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  67.3 
 
 		 494 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  67.72 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  65.35 
 
 		 517 aa  557  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  65.15 
 
 		 493 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  65.88 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  66.52 
 
 		 521 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.42 
 
 		 486 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  66.88 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  67.56 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  67.77 
 
 		 505 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  68.56 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  69.28 
 
 		 483 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  68.08 
 
 		 493 aa  541  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  69.06 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  69.06 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  61.88 
 
 		 553 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  63.52 
 
 		 522 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  68.78 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  65.27 
 
 		 512 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  65.71 
 
 		 515 aa  521  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  66.3 
 
 		 524 aa  519  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  63.71 
 
 		 546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  67.53 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  64.01 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  58.63 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  57.49 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  60.71 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  47.31 
 
 		 441 aa  340  4e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  51.84 
 
 		 422 aa  339  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.97 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  46.01 
 
 		 436 aa  337  3.9999999999999995e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  49.15 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.59 
 
 		 437 aa  329  7e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  47.55 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  46.31 
 
 		 395 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.25 
 
 		 414 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  47.55 
 
 		 440 aa  319  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  44.19 
 
 		 582 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  47.87 
 
 		 564 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  47.87 
 
 		 564 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  42.52 
 
 		 419 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  48.63 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  42.29 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  42.29 
 
 		 419 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  46.91 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  41.82 
 
 		 419 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  43.1 
 
 		 419 aa  309  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42.92 
 
 		 413 aa  309  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  41.82 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  50 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  41.59 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  42.37 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.12 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  41.82 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  41.82 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  49.59 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.65 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  43.88 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1906  GTP-binding proten HflX  48.49 
 
 		 583 aa  299  9e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.77 
 
 		 421 aa  296  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4208  GTP-binding protein, HSR1-related  47.81 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  43.37 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  42.07 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.56 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  44.69 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  44.13 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  44.82 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.25 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  44.74 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  44.13 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  42.3 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.32 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  42.53 
 
 		 597 aa  290  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.15 
 
 		 432 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  43.27 
 
 		 434 aa  289  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.65 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  42.43 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  44.5 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.99 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  45.23 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.99 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  41.88 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.72 
 
 		 415 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  43.73 
 
 		 430 aa  287  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.56 
 
 		 450 aa  286  8e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.73 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>