More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.62 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.92 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.63 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  45.6 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  44.31 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  39.45 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.44 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  38.24 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.55 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  35.36 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  38.08 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.52 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  35.98 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  35.16 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  34.11 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  33.46 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  35.45 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  33.33 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  33.85 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  33.62 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  33.62 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  31.27 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  34.35 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  32.68 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  32.71 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.57 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  36.41 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.55 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  28.14 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  31.14 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  31.42 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  34.1 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  29.69 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  31.94 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  27.2 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  36.53 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 402 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  33.03 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  29.53 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  33.48 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  30.52 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  32.26 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 		 296 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  28.02 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  31.96 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  27.73 
 
 		 317 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  32.46 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  33.03 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  29.86 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  32.58 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  27.31 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  32.58 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  30.28 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  28.44 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  30.59 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  31.44 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  30.73 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  30.59 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  30.59 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  31.58 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  30.62 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.05 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  29.68 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  32.73 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.72 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  31.53 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  28.63 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  29.86 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  30.73 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.86 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.86 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  34.53 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.58 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  36.43 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  32.47 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  25.81 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  30.13 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  26.3 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  34.03 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  27.88 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  34.03 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>