More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  53.66 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  59.16 
 
 
254 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  46.32 
 
 
195 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  47.73 
 
 
272 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  43 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  50.26 
 
 
220 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  45.28 
 
 
219 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  46.39 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  48.72 
 
 
232 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  57.75 
 
 
238 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  47.46 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  43.72 
 
 
197 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  49.39 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  46.93 
 
 
204 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  42.53 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  44.58 
 
 
207 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  40.93 
 
 
201 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 
243 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  53.46 
 
 
165 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  45.18 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  54.49 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  46.29 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  41.86 
 
 
182 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 
213 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  42.59 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  43.02 
 
 
188 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  38.79 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  42.19 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
150 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  32.98 
 
 
176 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 
157 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  31.52 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  35.47 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  38.71 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  34.09 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  37.11 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  33.88 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 
169 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 
155 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  38.99 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  31.36 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  38.12 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  33.74 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  34.31 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  34.19 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 
149 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.11 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.74 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  33.85 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.55 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  31.93 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  33.72 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  32.73 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
160 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  30.07 
 
 
145 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 
358 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  39.13 
 
 
157 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  32.92 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.05 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>