More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  100 
 
 
398 aa  788    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  51.59 
 
 
424 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  48.4 
 
 
407 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  42.6 
 
 
399 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  40.68 
 
 
415 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  41.35 
 
 
402 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  47.66 
 
 
400 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  42.74 
 
 
400 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  44.57 
 
 
374 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  43.97 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  44.93 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  39.73 
 
 
371 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  40.32 
 
 
372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  42.78 
 
 
424 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  40.62 
 
 
400 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  40.62 
 
 
400 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  40.62 
 
 
400 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  40.68 
 
 
377 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  42.27 
 
 
387 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  41.43 
 
 
391 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  36.62 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  40.92 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  41.67 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  38.85 
 
 
404 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  39 
 
 
402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  38.59 
 
 
397 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  36.44 
 
 
370 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  37.24 
 
 
388 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
371 aa  203  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  34.95 
 
 
384 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  34.62 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.12 
 
 
403 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  39 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  34.53 
 
 
394 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  38.3 
 
 
398 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  35.08 
 
 
380 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  36.79 
 
 
467 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  37.4 
 
 
403 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  37.17 
 
 
408 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 
400 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  32.72 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  34.67 
 
 
388 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  30.92 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.54 
 
 
496 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  34.62 
 
 
351 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  31.73 
 
 
423 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
413 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  32.32 
 
 
396 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 
386 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  33.88 
 
 
381 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.28 
 
 
396 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 
388 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 
434 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  31.48 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.45 
 
 
405 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  33.01 
 
 
393 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  29.4 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  31.27 
 
 
392 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  28.41 
 
 
376 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  26.16 
 
 
373 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 
411 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.33 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  28.69 
 
 
378 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  29.3 
 
 
376 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  31.86 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  27.37 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  28.69 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  26.69 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.5 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  26.95 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  26.69 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  26.69 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.55 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  27.05 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  24.79 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.12 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  27.27 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  26.45 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  23.38 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.67 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  26.36 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  26.27 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  30.28 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  25.3 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  25.13 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  27.88 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.25 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  25.3 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  29.29 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.66 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  27.02 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  24.72 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  27.25 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  27.54 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  24.53 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>