More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 		 507 aa  991    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  64.6 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  64.6 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  64.4 
 
 		 512 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  64.04 
 
 		 504 aa  594  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  61.26 
 
 		 506 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  61.6 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  61.92 
 
 		 509 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  63.05 
 
 		 502 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  59.26 
 
 		 492 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  53.13 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  50.6 
 
 		 519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  51.93 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  52.24 
 
 		 492 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  54.44 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  51.93 
 
 		 506 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  49.79 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  44.44 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  45.73 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  40.08 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  38.71 
 
 		 508 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  37.4 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  32.32 
 
 		 537 aa  270  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  36.83 
 
 		 504 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  38.27 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  38.02 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  36.18 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  38.35 
 
 		 508 aa  259  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  34.69 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  32.46 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  31.19 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  31.99 
 
 		 511 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  33.75 
 
 		 504 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  32.17 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  34.71 
 
 		 531 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  31.26 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  30.99 
 
 		 511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  33.82 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  33.74 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  32.02 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  34.41 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  32.99 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  31.36 
 
 		 493 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  31.33 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  35.18 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 504 aa  223  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  35.05 
 
 		 498 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.8 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  32.99 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  31.16 
 
 		 553 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  32.35 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  32.07 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  31.16 
 
 		 518 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  31.16 
 
 		 518 aa  209  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  32.35 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  29.21 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  34.72 
 
 		 525 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  31.71 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  31.14 
 
 		 495 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  32.58 
 
 		 491 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  30.5 
 
 		 536 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  31.2 
 
 		 499 aa  201  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  26.71 
 
 		 502 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  26.71 
 
 		 502 aa  200  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  33.2 
 
 		 530 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  30.66 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  31.67 
 
 		 495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  30.57 
 
 		 491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  33 
 
 		 530 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  26.73 
 
 		 494 aa  196  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  30.45 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  28.3 
 
 		 546 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  29.69 
 
 		 519 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  32.6 
 
 		 548 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  32.34 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  29.44 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  28.8 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  30.93 
 
 		 529 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  28.84 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  30.16 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  31.29 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  29.12 
 
 		 500 aa  178  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  31.3 
 
 		 506 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  27.39 
 
 		 542 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  30.02 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  29.55 
 
 		 527 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  28.08 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  27.76 
 
 		 490 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  27.51 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  25.63 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 516 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  30.29 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  26.04 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 551 aa  163  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  24.8 
 
 		 488 aa  163  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>